The Magic Order es una serie de cómics que narra la historia de cinco familias de magos que se encargan de proteger el mundo de las amenazas sobrenaturales y mágicas. Los miembros de la Orden Mágica viven entre el resto de la sociedad, ocultando su verdadera naturaleza. Sin embargo, la Orden se ve en peligro cuando un enemigo desconocido empieza a asesinarlos uno por uno. El objetivo del enemigo es obtener el Orichalcum, un libro mágico indestructible que contiene los hechizos oscuros de la antigua Atlántida y que puede matar a un dios.
La historia se centra en los Moonstone, una de las familias de la Orden Mágica. Leonard Moonstone es el líder de la Orden y el guardián del Orichalcum, que le fue legado por su tío Conrad. Leonard tiene tres hijos: Regan, Gabriel y Cordelia. Regan es un mago ambicioso y arrogante que desea el poder del Orichalcum. Gabriel es un mago poderoso que se ha retirado del mundo mágico tras la muerte de su esposa e hijo. Cordelia es una escapista alcohólica y rebelde que no se toma en serio su papel en la Orden.
El enemigo desconocido resulta ser el Veneciano, un mago renegado que fue expulsado de la Orden por sus crímenes. El Veneciano se ha aliado con Madame Albany, una maga oscura que lidera una facción disidente de la Orden. El Veneciano y Albany usan varios artefactos mágicos para atacar a los miembros de la Orden, como un devorador del tiempo, una cámara del alma y un asesino invisible.
El Veneciano logra infiltrarse en el castillo Moonstone, la base de la familia oculta en una dimensión dentro de un cuadro. Allí, asesina a Leonard y a varios miembros de la Orden. También revela que Regan es su cómplice y que lo ha ayudado a eliminar a los demás magos. Regan traicionó a su familia por resentimiento hacia su padre y por codicia hacia el Orichalcum.
Gabriel y Cordelia son los únicos supervivientes de los Moonstone. Gabriel decide volver al mundo mágico para vengar a su familia y detener al Veneciano y a Albany. Cordelia lo acompaña, aunque no confía en él por haberlos abandonado antes. Juntos, se enfrentan al Veneciano y a Albany en una batalla final.
Gabriel descubre que el Veneciano es en realidad su hermano gemelo perdido, que fue secuestrado por Albany cuando era un bebé. Albany lo crió como su hijo y lo entrenó para ser un mago malvado. Gabriel intenta convencer al Veneciano de que se una a él, pero este lo rechaza y lo ataca con el Orichalcum.
Cordelia interviene y logra arrebatarle el Orichalcum al Veneciano. Ella usa el libro para deshacer todos los hechizos oscuros que el Veneciano y Albany habían lanzado, incluyendo los que causaron la muerte de su familia. Cordelia sacrifica su vida para restaurar el equilibrio mágico y salvar al mundo.
Gabriel queda como el único miembro vivo de la Orden Mágica. Él decide honrar el legado de su familia y seguir protegiendo el mundo de las amenazas mágicas. Él también recupera a su esposa e hijo, que habían sido resucitados por el Orichalcum. Gabriel se convierte en el nuevo líder de la Orden Mágica y en el guardián del Orichalcum.
